See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Katrin Tomson

https://etis.ee/CV/Katrin_Tomson/est
23.01.1956
+372 5225643
katrin.tomson@ttu.ee
katrin.tomson@outlook.com

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.09.2014–30.11.2015   
AS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Teadur (1,00)
01.10.2013–31.08.2014   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Biotehnoloogia õppetool, Teadur (0,50)
01.01.2013–31.08.2014   
AS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Teadur (0,50)
01.10.2012–31.12.2012   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Genoomika ja proteoomika õppetool, Spetsialist (1,00)
01.10.2009–30.09.2012   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaardiagnostika õppetool, Erakorraline vanemteadur (1,00)
2008–30.09.2009   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaardiagnostika õppetool, Teadur (1,00)
01.01.2006–31.12.2007   
Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaardiagnostika õppetool; insener
01.01.1984–31.12.1984   
Talleksi Arvutuskeskuse programmeerija
01.01.1984–31.12.2005   
Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituudi Molekulaargeneetika Labori vaneminsener, nooremteadur, teadur
01.01.1979–31.12.1982   
Raadioelektroonika Konstrueerimisbüroo insener
 
 
Haridustee
2000–2005   
Tallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond, doktorant (bio- ja toiduainete tehnoloogia)
1974–1979   
Tartu Ülikool, Füüsika-keemiateaduskond, füüsik
 
 
Teadusorganisatsiooniline ja -administratiivne tegevus
1992−...   
Eesti Mikrobioloogia Seltsi liige
 
 
Lisainfo
Külalisteadur Exeter’i Ülikooli Biokonversiooni laboris (Inglismaa, 1998, 1 kuu), Londoni King’s College Biosensorite laboris (1994, 1 kuu), Turu Ülikooli Biotehnoloogialaboris (1994, 1 kuu), Orion-Farmos’e ja Helsingi Ülikooli Biotehnoloogia Instituudi laborites (korduvalt aastatel 1991-1993).

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Katrin Tomson, doktorikraad, 2007, (juh) Kalju Vanatalu; Toomas Paalme, Production of labelled recombinant proteins in fed-batch systems in Escherichia coli (Märgistatud rekombinantsete valkude tootmine Escherichia coli fed-batch süsteemides), Tallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond, Toiduainete instituut, Toidutehnoloogia õppetool.
Katrin Tomson, magistrikraad, 1979, (juh) Raivo Vilu, Study of amino acid biosynthesis in bacteria Chlorobium thiosulphatophilum using 13C-NMR, Tartu Ülikool, Füüsika-keemiateaduskond.
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 1. Bio- ja keskkonnateadused; 1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud; CERCS KLASSIFIKAATOR: T490 Biotehnoloogia ; TÄPSUSTUS: Rekombinantsete valkude ekspresseerimine, märgistamine ja puhastamine. Inimese G-valguga seotud retseptori Smoothened uurimine. Pre- ja probiootikumide uurimine.
ETIS KLASSIFIKAATOR: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika); TÄPSUSTUS: Rekombinantsete kultuuride kultiveerimine, rekombinantsete valkude ekspressiooni uurimine, valkude märgistamine stabiilsete isotoopidega, valkude tootmine.
 
 
Lisainfo
Kursused ja seminarid
Analyzing and Visualizing Data with Excel; Microsoft - DAT206x, 2016
MS Access; FunctionX, 2016
Google SketchUp for 3D Modeling; Alison, 2016
Data Science and Machine Learning Essentials; Microsoft Virtual Academy; 2016
Python; Codecademy, 2015
Introduction To Python Programming; Udemy,2014
Andmetöötlus ja arvutusmeetodid Python'iga; Tallinna Tehnikaülikool, 2014 sügissemester
Rakuvaba valgusünteesi kursus; Rootsi NMR Keskus; Göteborg 2010
Kasvajate metaboloomika: metoodikast biomarkeriteni; TTÜ; Tallinn, 2010
Sissejuhatus biomeditsiini tuumamagnetresonantsi; FP7 East NMR, TTÜ, KBFI, TÜ, Warwick’i Ülikool; Tallinn 2009
Proteoomika ja mass-spektromeetria; TTÜ GTI; 2007
Süsteemibioloogia: Medicel Integrator; Medicel ja TTÜ GTI 2006
Mass-spektromeetria; Applied Biosystems; 2006
Alusta keskelt (andmebaaside kursus); Oracle; 2005
Projektijuhtide koolitus; Esko Koolitus; 2004
Rekombinantsete valkude ekspresseerimine ja puhastamine; APBiotech; 2000
2D elektroforees; APBiotech; 2000
Valkude elektroforees; Pharmacia; 1996
Immunotehnoloogia kursus; Lundi Ülikool; 1995
Bioeetika õpetamise seminar; Euroopa Nõukogu; Varssavi1994
Biotehnoloogia rakendamine keskkonnas: riskide hindamise teaduslikud meetodid; UNIDO; Trieste1993

Lõppenud projektid

Juhendamisel väitekirjad

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
1.1.
2014
Adamberg, Signe; Tomson, Katrin; Vija, Heiki; Puurand, Marju; Kabanova, Natalja; Visnapuu, Triinu; Jõgi, Eerik; Alamäe, Tiina; Adamberg, Kaarel (2014). Degradation of fructans and production of propionic acid by Bacteroides thetaiotaomicron are enhanced by the shortage of amino acids. Frontiers in Nutrition, 1 (21), 1−10. DOI: 10.3389/fnut.2014.00021.
3.4.
2014
Adamberg, K.; Tomson, K.; Visnapuu, T.; Adamberg, S. (2014). Fructan metabolism by fecal culture using isothermal microcalorimetry. ENGIHR Conference, Karlsruhe, 24–26. September 2014; http://www.engihr.eu/2014-engihr-conference/.
3.4.
2013
Adamberg, S.; Tomson, K.; Vija, H.; Wadström, T.; Ljungh, Å.; Adamberg, K. (2013). Can isothermal microcalorimetry be used to characterise bacterial growth on prebiotic oligosaccharides? ENGIHR Conference, Valencia (Spain), 18-20 September 2013.
1.1.
2007
Massad, T.; Jarvet, J.; Tanner, R.; Tomson, K.; Smirnova, J.; Palumaa, P.; Sugai, M.; Kohno, T.; Vanatalu, K.; Damberg, P. (2007). Maximum entropy reconstruction of joint phi, psi-distribution with a coil-library prior: the backbone conformation of the peptide hormone motilin in aqueous solution from phi and psi-dependent J-couplings. Journal of Biomolecular NMR, 38 (2), 107−123.
2.3.
2007
Tomson, K. (2007). Production of labbelled recombinant proteins in fed-batch systems in Escherihia coli. (Doktoritöö, Tallinna Tehnikaülikool). Tallinna Tehnikaülikooli Kirjastus.
1.1.
2006
Tomson, K; Barber, J; Vanatalu, K (2006). Adaptastat--a new method for optimising of bacterial growth conditions in continuous culture: Interactive substrate limitation based on dissolved oxygen measurement. Journal of Microbiological Methods, 64, 380−390.
5.2.
2005
Tomson, K.; Vanatalu, K.; Smirnova, J.; Palumaa, P.; Tanner, R.; Jarvet, J.; Gräslund, A. (2005). Production and labeling of recombinant motilin in Escherichia coli. International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology, Badajoz, Spain, 15-18 March 2005.
5.2.
2004
Laht, Tiiu-Maie;Kask, Signe;Adamberg, Kaarel;Tomson, Katrin;Paalme, Toomas;Vilu, Raivo (2004). A model of swiss-type cheese ripening. IDF Symposium on Cheese: Ripening, Characterization and Technology : book of abstracts.. Prague: L.Houdek - Nakladatelstvi Galen, 75.
5.2.
2003
Tomson, K.; Vanatalu, K. (2003). Cultivation strategies for the production of deuterated recombinant proteins in Escherichia coli at high cell density. EMBO workshop on deuterium labelling for bio-molecular NMR and neutron scattering, 29th-31st January 2003, Grenoble.
1.1.
1996
Kahru, A.; Tomson, K.; Pall, T.; Külm, I. (1996). Study of toxicity of pesticides using luminescent bacteria Photobacterium phosphoreum. Water Science & Technology, 33 (6), 147−154.
1.1.
1995
TOMSON, K.; PAALME, T.; LAAKSO, PS et al. (1995). AUTOMATIC LABORATORY-SCALE FED-BATCH PROCEDURE FOR PRODUCTION OF RECOMBINANT PROTEINS USING INDUCIBLE EXPRESSION SYSTEMS OF ESCHERICHIA-COLI. Biotechnology Techniques, 9 (11), 793−798.

Tööstusomand

19.04.2019

Katrin Tomson

https://etis.ee/CV/Katrin_Tomson/eng
23.01.1956
+372 5225643
katrin.tomson@ttu.ee
katrin.tomson@outlook.com

Career

Institutions and positions
01.09.2014–30.11.2015   
Center of Food and Fermentation Technologies, Researcher (1,00)
01.10.2013–31.08.2014   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Chemistry, Chair of Biotechnology, Researcher (0,50)
01.01.2013–31.08.2014   
Center of Food and Fermentation Technologies, Researcher (0,50)
01.10.2012–31.12.2012   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Genomics and Proteomics, Specialist (1,00)
01.10.2009–30.09.2012   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Molecular Diagnostics, Extraordinary Senior Researcher (1,00)
2008–30.09.2009   
Tallinn University of Technology , Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Molecular Diagnostics, Researcher (1,00)
01.01.2006–31.12.2007   
Tallinn University of Technology, Faculty of Science, Department of Gene Technology, Chair of Molecular Diagnostics, engineer
01.01.1984–31.12.1984   
Computer Center of Talleks, software developer
01.01.1984–31.12.2005   
National Institute of Chemical Physics and Biophysics, senior engineer, junior research scientist, research scientist
01.01.1979–31.12.1982   
Bureau of Electronical Design, engineer
 
 
Education
2000–2005   
Tallinn University of Technology, Faculty of Chemical and Material Technology, PhD studies (food and biotechnology)
1974–1979   
Tartu University, 1979, physicist
 
 
R&D related managerial and administrative work
1992−...   
Member of the Estonian Society of Microbiology
 
 
Additional information
Visiting scientist in Laboratory of Bioconversions in Exeter University (England, 1998, 1 month), in Laboratory of Biosensors in London King’s College (1994, 1 month), in Laboratory of Biotechnology of Turku University (Finland, 1994, 1 month), in the laboratories of Orion-Farmos and Institute of Biotechnology of Helsinki University (many times during 1991-1993).

Qualifications

Academic degrees
Katrin Tomson, Doctor's Degree, 2007, (sup) Kalju Vanatalu; Toomas Paalme, Production of labelled recombinant proteins in fed-batch systems in Escherichia coli, Tallinn University of Technology Faculty of Chemical and Materials Technology, Department of Food Processing, Chair of Food Technology.
Katrin Tomson, Master's Degree, 1979, (sup) Raivo Vilu, Study of amino acid biosynthesis in bacteria Chlorobium thiosulphatophilum using 13C-NMR (Study of amino acid biosynthesis in bacteria Chlorobium thiosulphatophilum using 13C-NMR), University of Tartu, Faculty of Physics and Chemistry.
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 1. Biosciences and Environment; 1.12. Biotechnology, Molecular Biology, Cell Biology, Biophysics and Economic and Technological Research relating to Bio- and Environmental Sciences; CERCS CLASSIFICATION: T490 Biotechnology ; SPECIFICATION: Expression, labelling and purification of recombinant proteins. Study of human Smoothened, a G-protein coupled receptor. Study of pre- and probiotics.
ETIS CLASSIFICATION: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.16. Biotechnology relating to Natural Sciences and Engineering
 
 
Additional information
Courses and seminars
Analyzing and Visualizing Data with Excel; Microsoft - DAT206x, 2016
MS Access; FunctionX, 2016
Google SketchUp for 3D Modeling; Alison, 2016
Data Science and Machine Learning Essentials; Microsoft Virtual Academy; 2016
Python; Codecademy, 2015
Introduction To Python Programming; Udemy,2014
Data Analysis and Computational Methods with Python; Tallinn University of Technology,2014 fall semester
Workshop on cell-free protein synthesis; Swedish NMR Centre; Göteborg 2010
Cancer Metabolomics: From Methodology to Biomarkers; TTU; Tallinn, 2010
Introduction to biomedical NMR; FP7 East NMR, TTU, NICPB, TU, University of Warwick; Tallinn 2009
Proteomics and mass spectrometry; Tallinn University of Technology Dept. of Gene Technology; 2007
Biological data integration and analysis: Medicel Integrator; Medicel and TTU Dept. of GT; 2006
Mass spectrometry; Applied Biosystems; 2006
Start in the middle (databases); Oracle; 2005
Education of project leaders; Esko Koolitus 2004
Amplification and purification of recombinant proteins; APBiotech; 2000
2D electrophoresis; APBiotech; 2000
Electrophoresis; Pharmacia; 1996
Immunotechnology course; Lund University; 1995
Seminar on the teaching of bioethics; Council of Europe; Warsov 1994
Environmental applications of biotechnology: scientific risk assessment methodologies, course; UNIDO; Trieste1993

Completed projects

Dissertations under supervision

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
1.1.
2014
Adamberg, Signe; Tomson, Katrin; Vija, Heiki; Puurand, Marju; Kabanova, Natalja; Visnapuu, Triinu; Jõgi, Eerik; Alamäe, Tiina; Adamberg, Kaarel (2014). Degradation of fructans and production of propionic acid by Bacteroides thetaiotaomicron are enhanced by the shortage of amino acids. Frontiers in Nutrition, 1 (21), 1−10. DOI: 10.3389/fnut.2014.00021.
3.4.
2014
Adamberg, K.; Tomson, K.; Visnapuu, T.; Adamberg, S. (2014). Fructan metabolism by fecal culture using isothermal microcalorimetry. ENGIHR Conference, Karlsruhe, 24–26. September 2014; http://www.engihr.eu/2014-engihr-conference/.
3.4.
2013
Adamberg, S.; Tomson, K.; Vija, H.; Wadström, T.; Ljungh, Å.; Adamberg, K. (2013). Can isothermal microcalorimetry be used to characterise bacterial growth on prebiotic oligosaccharides? ENGIHR Conference, Valencia (Spain), 18-20 September 2013.
1.1.
2007
Massad, T.; Jarvet, J.; Tanner, R.; Tomson, K.; Smirnova, J.; Palumaa, P.; Sugai, M.; Kohno, T.; Vanatalu, K.; Damberg, P. (2007). Maximum entropy reconstruction of joint phi, psi-distribution with a coil-library prior: the backbone conformation of the peptide hormone motilin in aqueous solution from phi and psi-dependent J-couplings. Journal of Biomolecular NMR, 38 (2), 107−123.
2.3.
2007
Tomson, K. (2007). Production of labbelled recombinant proteins in fed-batch systems in Escherihia coli. (Doktoritöö, Tallinna Tehnikaülikool). Tallinna Tehnikaülikooli Kirjastus.
1.1.
2006
Tomson, K; Barber, J; Vanatalu, K (2006). Adaptastat--a new method for optimising of bacterial growth conditions in continuous culture: Interactive substrate limitation based on dissolved oxygen measurement. Journal of Microbiological Methods, 64, 380−390.
5.2.
2005
Tomson, K.; Vanatalu, K.; Smirnova, J.; Palumaa, P.; Tanner, R.; Jarvet, J.; Gräslund, A. (2005). Production and labeling of recombinant motilin in Escherichia coli. International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology, Badajoz, Spain, 15-18 March 2005.
5.2.
2004
Laht, Tiiu-Maie;Kask, Signe;Adamberg, Kaarel;Tomson, Katrin;Paalme, Toomas;Vilu, Raivo (2004). A model of swiss-type cheese ripening. IDF Symposium on Cheese: Ripening, Characterization and Technology : book of abstracts.. Prague: L.Houdek - Nakladatelstvi Galen, 75.
5.2.
2003
Tomson, K.; Vanatalu, K. (2003). Cultivation strategies for the production of deuterated recombinant proteins in Escherichia coli at high cell density. EMBO workshop on deuterium labelling for bio-molecular NMR and neutron scattering, 29th-31st January 2003, Grenoble.
1.1.
1996
Kahru, A.; Tomson, K.; Pall, T.; Külm, I. (1996). Study of toxicity of pesticides using luminescent bacteria Photobacterium phosphoreum. Water Science & Technology, 33 (6), 147−154.
1.1.
1995
TOMSON, K.; PAALME, T.; LAAKSO, PS et al. (1995). AUTOMATIC LABORATORY-SCALE FED-BATCH PROCEDURE FOR PRODUCTION OF RECOMBINANT PROTEINS USING INDUCIBLE EXPRESSION SYSTEMS OF ESCHERICHIA-COLI. Biotechnology Techniques, 9 (11), 793−798.

Industrial property

19.04.2019

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
Lihtotsing Tühjenda
  • Leitud 7 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFJDJD155Cloning, overexpression and labelling of intracellular C-terminal domain of human Smoothened (a receptor protein synthesised from proto-oncogene) in Escherichia coli system for functional and structural studies01.10.200930.09.2012Katrin TomsonTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond74 776,63 EUR
MUULep16071Imikupiimasegude koostise modifitseerimine vastavalt viimastele teadustulemustele põhirõhuga piimarasva kasutamisel11.05.201620.02.2017Signe AdambergTallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond, Toiduainete instituut, Toidutehnoloogia õppetool28 400,00 EUR
ETFETF6847Rekombinantsete valkude in-vivo isotoopmärgistamise on-line optimeerimine.01.01.200631.12.2009Kalju VanataluTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond30 978,24 EUR
SFSF0140055s08Struktuurne ja meditsiiniline metalloproteoomika01.01.200831.12.2013Peep PalumaaTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond937 814,19 EUR
SFSF0140145As08Tuumorprogressiooni molekulaarbioloogia: molekulaarsed mehhanismid ja biomeditsiinilised rakendused01.01.200831.12.2013Andres ValknaTallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond616 089,84 EUR
MUUAR12170Uudsete levaansukraaskatalüsaatorite disain ja kasutamine funktsionaalsete toidulisandite tootmiseks (FFI)01.10.201231.08.2015Signe AdambergTallinna Tehnikaülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Keemia ja materjalitehnoloogia teaduskond, Toiduainete instituut, Toidutehnoloogia õppetool62 384,70 EUR
MUU3.2.0701.12–0041Uudsete levaansukraaskatalüsaatorite disain ja kasutamine funktsionaalsete toidulisandite tootmiseks (FFI)01.10.201231.08.2015Kaarel AdambergAS Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus65 261,17 EUR