See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus

Konstantin Tretjakov

https://etis.ee/CV/Konstantin_Tretjakov/est
20.12.1982
737 6137
kt@ut.ee
Skype: konstantin.tretjakov
Veeb: http://kt.era.ee/

Teenistuskäik

Töökohad ja ametid
01.08.2013–31.10.2015   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, bioinformaatika teadur (1,00)
01.01.2012–31.12.2013   
Ideelabor OÜ, Konsultant-arendaja (KRATT plagiaadituvastuse süsteem)
01.09.2010–01.07.2013   
STACC OÜ, Vanemteadusinsener (sotsiaalvõrgustikke analüüsi projekt) (0,50)
01.09.2010–31.07.2013   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, teadur (0,50)
01.01.2010–31.12.2010   
University of California San Diego, Külalisdoktorant (geeniekspressiooni ja DNA sekventsi andmete kombineeritud analüüs, lineaarsed mudelid)
15.12.2009–15.07.2010   
STACC OÜ, Vanemteadusinsener (sotsiaalvõrgustikke analüüs, veeblilogi analüüs, soovitussüsteemide arendus) (0,20)
01.09.2009–15.12.2009   
STACC OÜ, Vanemteadusinsener (sotsiaalvõrgustikke analüüs, veeblilogi analüüs, soovitussüsteemide arendus) (1,00)
01.11.2008–30.06.2009   
ELIKO Tehnoloogia Arenduskeskus OÜ, Projekti juht (Veebilogi andmete analüüsimeetodite ja -tarkvara arendus) (0,40)
01.02.2008–31.08.2008   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, programmeerija (0,90)
01.01.2006–31.12.2006   
University of Bristol, Külalisuurija (geeni ekspressiooni andmete analüüs)
2005–2008   
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond, Arvutiteaduse instituut, Tarkvarasüsteemide õppetool, programmeerija (Geeniandmete analüüsimeetodite arendus) (1,00)
01.02.2003–01.10.2005   
WebMedia AS, Java arendaja (Veebiraamistikud, CRM süsteemide arendus, E-haiguslugu eHL) (0,50)
 
 
Haridustee
2008–...   
Tartu Ülikool. Doktorant informaatikas.
2005–2008   
Tartu Ülikool. M.Sc. informaatikas
2001–2005   
Tartu Ülikool. B.Sc. informaatikas (cum laude)
1990–2001   
Tallinna humanitaargümnaasium. (lõpetanud hõbemedaliga)
 
 
Lisainfo
alates 2001/10 - EIO (Eesti Informaatika Olümpiaad) korraldustoimkonna ja žüriiliige, BOI 2003 (Baltic Olympiad in Informatics) korraldustoimkonna liige, mitmete õpilaste mänguprogrammeerimisvõistluste kaaskorraldaja (Cobbler, StopGate, Piljard)
alates 2004/09 - TÜ Arvutiteaduse Tarkvaraarenduse Serveri ja kursuste serveri administraator (ats.cs.ut.ee, courses.cs.ut.ee)
alates 2002/03 - Regulaarselt osalen riiklike matemaatikaolümpiaadide korraldamises
alates 2004 - TÜ Arvutiteaduse instituudi mitmete uute kursuste ja seminaride loomine ja läbiviimine. Serveri courses.cs.ut.ee asutaja.
alates 2005 - TU ATIs õpetatud/osaliselt õpetatud/korraldatud kursused: Neurovõrgud (MTAT.03.186, 2005), Arvutigraafika (MTAT.03.015, 2005), Tarkvaratehnika (MTAT.03.094, 2005-2006), Computational Pattern Analysis and Statistical Learning (MTAT.03.205, 2006), The Mathematics of Sound and Music (MTAT.03.210, 2007), Sissejuhatus Informaatikasse (MTAT.05.074, 2009), Andmekaeve (MTAT.03.183, 2009), Bioinformaatika (MTAT.03.239, 2010)
2011.05 - BREW2011 bioinformaatika konverentsi korraldamine (http://brew2011.cs.ut.ee/)

Kvalifikatsioon

Teaduskraadid
Konstantin Tretjakov, magistrikraad (teaduskraad), 2008, (juh) Jaak Vilo; Sven Laur, G=MAT: Linking Transcription Factor Expression with DNA Binding (G=MAT: meetod geeniekspressiooni ja DNA seondumisandmete ühendamiseks), Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond.
Konstantin Tretjakov, doktorant, (juh) Jaak Vilo; Sven Laur, Machine learning methods in Bioinformatics (Masinõpe meetodid bioinformaatikas), Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond.
 
 
Teaduspreemiad ja tunnustused
2008, Konstantin Tretjakov, Haridus- ja Teadusministeeriumi üliõpilaste teadustööde riikliku konkursi I preemia Magistritöö eest
 
 
Teadustöö põhisuunad
ETIS KLASSIFIKAATOR: 4. Loodusteadused ja tehnika; 4.6. Arvutiteadused; TÄPSUSTUS: Bioinformaatika, Masinõpe, Signaalitöötlus
 
 
Lisainfo
Esinesin edukalt rahvusvahelistel matemaatika- ja informaatikavõistlustel IMO, IMC ning ACM.
Keelte oskus: Vene, inglise, eesti (väga hea); saksa, prantsuse (natuke alla keskmist); läti, itaalia (algaja)
ITL Ustus Aguri nimelise stipendiumi võitja 2011.

Lõppenud projektid

Juhendatud väitekirjad

Publikatsioonid

Klass
Aasta
Publikatsioon
 
3.4.
2014
Floreskul, Volodymyr; Tretjakov, Konstantin; Dumas, Marlon (2014). Memory-Efficient Fast Shortest Path Estimation in Large Social Networks. Eighth International AAAI Conference on Weblogs and Social Media (ICWSM). AAAI Press, 91−100.
1.1.
2013
Tretyakov, Konstantin; Laur, Sven; Smant, Geert; Vilo, Jaak; Prins, Pjotr (2013). Fast probabilistic file fingerprinting for big data. BMC Genomics, 14 (2), S8. DOI: 10.1186/1471-2164-14-S2-S8.
3.4.
2013
Tretyakov, Konstantin; Goldberg, Tatyana; Jin, Victor X; Horton, Paul (2013). Summary of talks and papers at ISCB-Asia/SCCG 2012. BMC Genomics, 14, I1. DOI: 10.1186/1471-2164-14-S2-I1.
3.1.
2012
Leontjeva, Anna ; Tretyakov, Konstantin ; Vilo, Jaak ; Tamkivi, Taavi (2012). Fraud Detection: Methods of Analysis for Hypergraph Data. In Proceedings of the First IEEE/ACM International Workshop on Cybersecurity of Online Social Networks (IEEE/ACM CSOSN 2012): IEEE/ACM International Workshop on Cybersecurity of Online Social Network (IEEE/ACM CSOSN), Istanbul. IEEE Conference Publications, 1060−1064.
6.3.
2012
Tretjakov, Konstantin (2012). Robotiehituse lihtne valem. Arvutimaailm, 52−53.
1.1.
2011
Tretyakov, K.; Laur, S.; Vilo, J. (2011). G = MAT: Linking Transcription Factor Expression and DNA Binding Data. PLoS ONE, 6 (1), e14559. DOI: 10.1371/journal.pone.0014559.
3.1.
2011
Tretyakov, Konstantin; Armas-Cervantes, Abel; García-Bañuelos, Luciano; Vilo, Jaak; Dumas, Marlon (2011). Fast Fully Dynamic Landmark-based Estimation of Shortest Path Distances in Very Large Graphs. CIKM’11, October 24–28, 2011, Glasgow, Scotland, UK.. Association for Computing Machinery (ACM), 1785−1794. DOI: 10.1145/2063576.2063834.
1.1.
2010
Billon, Nathalie; Kolde, Raivo; Reimand, Juri; Monteiro, Miguel C; Kull, Meelis; Peterson, Hedi; Tretyakov, Konstantin; Adler, Priit; Wdziekonski, Brigitte; Vilo, Jaak; Dani, Christian (2010). Comprehensive transcriptome analysis of mouse embryonic stem cell adipogenesis unravels new processes of adipocyte development. Genome Biology, 11 (8), R80. DOI: 10.1186/gb-2010-11-8-r80.
3.1.
2010
Kull, M.; Tretyakov, K.; Vilo, J. (2010). An evolutionary model of DNA substring distribution. In: Elomaa,T.; Mannila, H.; Orponen, P. (Ed.). Algorithms and Applications (147−157). . Berlin / Heidelberg: Springer. (Lecture Notes in Computer Science). DOI: 10.1007/978-3-642-12476-1_10.
3.1.
2008
Tkatchenko, A.; Tretjakov, K.; Adler, P.; Vilo, J. (2008). Text mining for automatic annotation of microarray experiment clusters. Databases and Information Systems: 8th International Baltic Conference on Databases and Information Systems; Tallinn; 02-05 June 2008. Ed. Haav, H.-M.; Kalja, A. Tallinn University of Technology Press, 423−426.
3.2.
2007
Tretyakov, K. (2007). Machine Learning Techniques in Spam Filtering. In: Satish, D.; Prabhakar, K.R. (_EditorsAbbr). Combating Spam (6−33).. The ICFAI University Press.

Tööstusomand

18.04.2019

Konstantin Tretjakov

https://etis.ee/CV/Konstantin_Tretjakov/eng
20.12.1982
737 6137
kt@ut.ee
Skype: konstantin.tretjakov
Web: http://kt.era.ee/

Career

Institutions and positions
01.08.2013–31.10.2015   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Research Fellow in Bioinformatics (1,00)
01.01.2012–31.12.2013   
Ideelabor OÜ, Consultant-developer (KRATT plagiarism detection system)
01.09.2010–01.07.2013   
STACC , Senior research engineer (social network analysis project) (0,50)
01.09.2010–31.07.2013   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Research Fellow (0,50)
01.01.2010–31.12.2010   
University of California San Diego, Visiting graduate student (combined analysis of DNA sequence and gene expression data, linear models)
15.12.2009–15.07.2010   
STACC , Senior research engineer (social network analysis, log mining, recommender system development) (0,20)
01.09.2009–15.12.2009   
STACC , Senior research engineer (social network analysis, log mining, recommender system development) (1,00)
01.11.2008–30.06.2009   
ELIKO Competence Centre in Electronics-, Info- and Communication Technologies, Project developer (Software and methods for analysis of web log data) (0,40)
01.02.2008–31.08.2008   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Programmer (0,90)
01.01.2006–31.12.2006   
University of Bristol, Visiting fellow (gene expression data analysis)
2005–2008   
University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science, Institute of Computer Science, Chair of Software Systems, programmer (Methods for analysis of genetic data) (1,00)
01.02.2003–01.10.2005   
WebMedia AS, Java developer (Web frameworks, CRM systems development, E-medical record project eHL) (0,50)
 
 
Education
2008–...   
University of Tartu. PhD student, informatics.
2005–2008   
University of Tartu. M.Sc in informatics
2001–2005   
University of Tartu. B.Sc in informatics (cum laude)
1990–2001   
Tallinn high school of humanities. (graduation with a silver medal)
 
 
Additional information
since 2001/10 - EIO (Estonian Informatics Olympiad) jury member. BOI 2003 organizing committee member, organizer of a number of game programming contests for schoolchildren (Cobbler, StopGate, Piljard).
since 2004/09 - Server administrator of certain university servers (ats.cs.ut.ee, courses.cs.ut.ee).
since 2002/03 - Regularly contribute to the organization of state mathematics olympiads
since 2004 - Creation, lecturing and supervision of a number of new courses at the Institute of Computer Science. Founder of courses.cs.ut.ee.
since 2005 - Courses taught/contributed to/organized at UT CS institute: Neural Networks (MTAT.03.186, 2005), Computer Graphics (MTAT.03.015, 2005), Software Engineering (MTAT.03.094, 2005-2006), Computational Pattern Analysis and Statistical Learning (MTAT.03.205, 2006), The Mathematics of Sound and Music (MTAT.03.210, 2007), Introduction to Informatics (MTAT.05.074, 2009), Data Mining (MTAT.03.183, 2009), Bioinformatics (MTAT.03.239, 2010)
2011.05 - Organizer of the BREW2011 bioinformatics conference (http://brew2011.cs.ut.ee/)

Qualifications

Academic degrees
Konstantin Tretjakov, Research Master's Degree, 2008, (sup) Jaak Vilo; Sven Laur, G=MAT: Linking Transcription Factor Expression with DNA Binding, University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science.
Konstantin Tretjakov, Phd student, (sup) Jaak Vilo; Sven Laur, Machine learning methods in Bioinformatics, University of Tartu, Faculty of Mathematics and Computer Science.
 
 
Honours & awards
2008, Konstantin Tretjakov, Estonian Ministry of Education and Research National Contest for Young Scientists at university level: I prize for the Master's thesis
 
 
Fields of research
ETIS CLASSIFICATION: 4. Natural Sciences and Engineering; 4.6. Computer Sciences; SPECIFICATION: Bioinformatics, Machine Learning, Signal Processing
 
 
Additional information
Successfully participated in the international mathematics and informatics contests IMO, IMC and ACM.
Languages: Russian, English, Estonian (very good); German, French (slightly below average); Latvian, Italian (beginner)
Winner of the ITL's Ustus Agur scholarship 2011.

Completed projects

Supervised dissertations

Publications

Category
Year
Publication
 
3.4.
2014
Floreskul, Volodymyr; Tretjakov, Konstantin; Dumas, Marlon (2014). Memory-Efficient Fast Shortest Path Estimation in Large Social Networks. Eighth International AAAI Conference on Weblogs and Social Media (ICWSM). AAAI Press, 91−100.
1.1.
2013
Tretyakov, Konstantin; Laur, Sven; Smant, Geert; Vilo, Jaak; Prins, Pjotr (2013). Fast probabilistic file fingerprinting for big data. BMC Genomics, 14 (2), S8. DOI: 10.1186/1471-2164-14-S2-S8.
3.4.
2013
Tretyakov, Konstantin; Goldberg, Tatyana; Jin, Victor X; Horton, Paul (2013). Summary of talks and papers at ISCB-Asia/SCCG 2012. BMC Genomics, 14, I1. DOI: 10.1186/1471-2164-14-S2-I1.
3.1.
2012
Leontjeva, Anna ; Tretyakov, Konstantin ; Vilo, Jaak ; Tamkivi, Taavi (2012). Fraud Detection: Methods of Analysis for Hypergraph Data. In Proceedings of the First IEEE/ACM International Workshop on Cybersecurity of Online Social Networks (IEEE/ACM CSOSN 2012): IEEE/ACM International Workshop on Cybersecurity of Online Social Network (IEEE/ACM CSOSN), Istanbul. IEEE Conference Publications, 1060−1064.
6.3.
2012
Tretjakov, Konstantin (2012). Robotiehituse lihtne valem. Arvutimaailm, 52−53.
1.1.
2011
Tretyakov, K.; Laur, S.; Vilo, J. (2011). G = MAT: Linking Transcription Factor Expression and DNA Binding Data. PLoS ONE, 6 (1), e14559. DOI: 10.1371/journal.pone.0014559.
3.1.
2011
Tretyakov, Konstantin; Armas-Cervantes, Abel; García-Bañuelos, Luciano; Vilo, Jaak; Dumas, Marlon (2011). Fast Fully Dynamic Landmark-based Estimation of Shortest Path Distances in Very Large Graphs. CIKM’11, October 24–28, 2011, Glasgow, Scotland, UK.. Association for Computing Machinery (ACM), 1785−1794. DOI: 10.1145/2063576.2063834.
1.1.
2010
Billon, Nathalie; Kolde, Raivo; Reimand, Juri; Monteiro, Miguel C; Kull, Meelis; Peterson, Hedi; Tretyakov, Konstantin; Adler, Priit; Wdziekonski, Brigitte; Vilo, Jaak; Dani, Christian (2010). Comprehensive transcriptome analysis of mouse embryonic stem cell adipogenesis unravels new processes of adipocyte development. Genome Biology, 11 (8), R80. DOI: 10.1186/gb-2010-11-8-r80.
3.1.
2010
Kull, M.; Tretyakov, K.; Vilo, J. (2010). An evolutionary model of DNA substring distribution. In: Elomaa,T.; Mannila, H.; Orponen, P. (Ed.). Algorithms and Applications (147−157). . Berlin / Heidelberg: Springer. (Lecture Notes in Computer Science). DOI: 10.1007/978-3-642-12476-1_10.
3.1.
2008
Tkatchenko, A.; Tretjakov, K.; Adler, P.; Vilo, J. (2008). Text mining for automatic annotation of microarray experiment clusters. Databases and Information Systems: 8th International Baltic Conference on Databases and Information Systems; Tallinn; 02-05 June 2008. Ed. Haav, H.-M.; Kalja, A. Tallinn University of Technology Press, 423−426.
3.2.
2007
Tretyakov, K. (2007). Machine Learning Techniques in Spam Filtering. In: Satish, D.; Prabhakar, K.R. (_EditorsAbbr). Combating Spam (6−33).. The ICFAI University Press.

Industrial property

18.04.2019

Otsi projekti

  • {{item.Name}}
Asutus on projekti finantseerija   Asutus on projekti teostaja  
  • {{searchListItem.Name}}
Kõik   Tavaprojektid   Ülemprojektid   Alamprojektid  
Uus Frascati (2015)
Uus ja vana Frascati (otsing uue järgi väljastab ka seotud vanad)
Kõik
Käimasolevad
Lõppenud
Algus
Hajus
Täpne
Lihtotsing Tühjenda
  • Leitud 8 kirjet
ProgrammLiikNumberNimiProjekti algusProjekti lõppVastutav täitjaAsutusFinantseerijapoolne rahastamine
ETFETF5722Andmekaevanduse meetodid ja rakendused (DMMA)01.01.200431.12.2006Jaak ViloTartu Ülikool24 652,75 EUR
IUTIUT34-4Andmeteaduse meetodid ja rakendused (DSMA)01.01.201531.12.2020Jaak ViloTartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, arvutiteaduse instituut699 600,00 EUR
MUUSMTAT12172 (12030118)Doktorantide mobiilsus: The European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases (ECML PKDD)23.09.201201.10.2012Jaak ViloTartu Ülikool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond1 448,04 EUR
TKAlamprojektTAR16013 (EXCITE) (TK148)IT Tippkeskus EXCITE01.09.201601.03.2023Maarja KruusmaaTallinna Tehnikaülikool, Infotehnoloogia teaduskond, Biorobootika keskus; Cybernetica AS2 121 014,65 EUR
SFSF0180008s12Kaasaegsed teadusarvutuste meetodid, platvormid ja rakendused. 01.01.201231.12.2014Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond306 870,00 EUR
MUUSMTAT09072Lähetus: International Conference on Machine Learning. Montreal, Kanada13.06.200925.06.2009Konstantin TretjakovTartu Ülikool1 080,11 EUR
ETFETF7437Paljude geeniekspressiooniandmete ühisanalüüs (MEM)01.01.200831.12.2011Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond64 222,50 EUR
SFSF0182712s06Suuremahuliste ja keeruliste arvutusülesannete lahendamise meetodid, arvutuskeskkonnad ja rakendused.01.01.200631.12.2011Jaak ViloTartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond584 274,70 EUR