Struktuur
Asutuse üldandmed
Molekulaartehnoloogia õppetool
Chair of Molecular Technology
–
31.12.2015
avalik-õiguslik juriidiline isik
Kontakt
Eesti Vabariik
Tartu
(+372) 737 5261
Publikatsioon | Autorid | Aasta | Väljaande pealkiri | Klassifikaator | Fail | Asutused | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Design, discovery, modelling, synthesis, and biological evaluation of novel and small, low toxicity s-triazine derivatives as HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors | Viira, Birgit; Selyutina, Anastasia; García-Sosa, Alfonso T.; Karonen, Maarit; Sinkkonen, Jari; Merits, Andres; Maran Uko | 2016 | Bioorganic & Medicinal Chemistry | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut | ||
Indole-like Trk receptor antagonists | Tammiku-Taul, J.; Park, R.; Jaanson, K.; Luberg, K.; Dobchev, D. A.; Kananovich, D.; Noole, A.; Mandel, M.; Kaasik, A.; Lopp, M.; Timmusk, T.; Karelson, M. | 2016 | European Journal of Medicinal Chemistry | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool; Tartu Ülikool, Meditsiiniteaduste valdkond, bio- ja siirdemeditsiini instituut; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Orgaanilise keemia õppetool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaarbioloogia õppetool | ||
Indole-like Trk receptor antagonists | Tammiku-Taul, J.; Park, R.; Jaanson, K.; Luberg, K.; Dobchev, D.A.; Kananovich, D.; Noole, A.; Mandel, M.; Kaasik, A.; Lopp, M.; Timmusk, T.; Karelson, M. | 2016 | 5.2. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | |||
Macrocyclic peptidomimetics with antimicrobial activity: synthesis, bioassay, and molecular modeling studies | Ibrahim, M.A.; Panda, S.S.; Oliferenko, A.; Oliferenko, P.V.; Girgis, A., Elagawany, M.; Küçükbay, F.Z.; Panda, C.S.; Pillai, G.G.; Samir, A.; Tämm, K.; Hall, C.D.; Katritzky, A.R. | 2015 | Organic & Biomolecular Chemistry | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Orgaanilise keemia õppetool ; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut | ||
QSAR DataBank repository: open and linked qualitative and quantitative structure–activity relationship models | Ruusmann, V.; Sild, S.; Maran, U. | 2015 | Journal of Cheminformatics | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Quantitative structure–permeability relationships at various pH values for acidic and basic drugs and drug-like compounds | Oja, M.; Maran, U. | 2015 | SAR and QSAR in Environmental Research | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
RNA interference-guided targeting of hepatitis C virus replication with antisense locked nucleic acid-based oligonucleotides containing 8-oxo-dG modifications | Mutso, M.; Nikonov, A.; Pihlak, A.; Žusinaite, E.; Viru, L.; Selyutina, A.; Reintamm, T.; Kelve, M.; Saarma, M.; Karelson, M.; Merits, A. | 2015 | PLoS ONE | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Geenitehnoloogia instituut, Molekulaardiagnostika õppetool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Synthesis of Unprotected CH2-Skipped Piperazine-Pyridine Alternating Cycles with Azide End-Group | Kipper, Andi; Kalvet, Indrek; Tämm, Kaido; Sikk, Lauri; Burk, Peeter; Kõiv, Kuldar; Mäeorg, Uno | 2015 | Heterocycles | 1.1. | Tartu Ülikool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Orgaanilise keemia õppetool ; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut | ||
Synthesis, and QSAR analysis of anti-oncological active spiro-alkaloids | Girgis, Adel S; Panda, Siva S; Farag, IS Ahmed; El-Shabiny, AM; Moustafa, AM; Ismail, Nasser SM; Pillai, Girinath G; Panda, Chandramukhi S; Hall, C Dennis; Katritzky, Alan R. | 2015 | Organic & Biomolecular Chemistry | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; MolCode AS | ||
Synthesis, bioassay, and QSAR study of bronchodilatory active 4H-pyrano[3,2-c]pyridine-3-carbonitriles | Girgis, Adel S.; Saleh, Dalia O.; George, Riham F.; Srour, Aladdin M.; Pillai, Girinath G.; Panda, Chandramukhi S.; Katritzky, Alan R. | 2015 | European Journal of Medicinal Chemistry | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; MolCode AS | ||
The permeability of an artificial membrane for wide range of pH in human gastrointestinal tract: experimental measurements and quantitative structure-activity relationship | Oja, M.; Maran, U. | 2015 | Molecular Informatics | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Theoretical Modeling of HPV: QSAR and Novodesign with Fragment Approach | Pillai, Girinath G.; Sikk, Lauri; Tamm, Tarmo; Karelson, Mati; Burk, Peeter; Tamm, Kaido. | 2015 | Current Computer Aided-Drug Design | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Virtual screening for HIV protease inhibitors using a novel database filtering procedure | Takkis, Kalev; García-Sosa, Alfonso T.; Sild, Sulev | 2015 | Molecular Informatics | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Prediction of Cell-Penetrating peptides | Hällbrink, Mattias; Karelson, Mati | 2015 | Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) | 3.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Role of Water Molecules and Hydration Properties in Modeling Ligand-Protein Interaction and Drug Design in: In Silico Drug Discovery and Design: Theory, Methods, Challenges, and Applications. | Garcia-Sosa, Alfonso T. | 2015 | CRC Press | 3.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Accessibility of Published QSAR Models: Ecotoxic Endpoints | Kahn, I.; Ahte, P.; Sild, S.; Maran, U. | 2015 | ALTEX Proceedings | 5.2. | Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Exploring and predicting in QsarDB repository: membrane permeability QSAR model over gastrointestinal tract pH-range | Oja, M.; Sild, S.; Maran, U. | 2015 | PCMDDD4 Book of Abstracts | 5.2. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Fragment-based QSAR Approach for Novel Indole-like TRKA Receptor Antagonist | Tammiku-Taul, J.; Dobchev, D. A.; Karelson, M.; Timmusk, T.; Park, R.; Jaanson, K.; Luberg, K.; Kananovich, D.; Noole, A.; Kanger, T.; Lopp, M. | 2015 | 5.2. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool; Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | |||
In Silico Approach to Finding New Scaffolds for LRRK2 Inhibition | Kahn, Iiris; Lomaka, Andre; Karelson, Mati | 2015 | Abstracts | 5.2. | Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond, Keemiainstituut, Molekulaartehnoloogia õppetool; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Measuring and modelling pH-dependence of passive transport in artificial membrane for wide range of pH | Oja, M.; Maran, U. | 2015 | PCMDDD4 Book of Abstracts | 5.2. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
QsarDB: chemo-informatics solution for preserving and efficient use of in silico physicochemical, toxicological, biochemical and human health endpoint models | Maran, U.; Sild, S.; Ruusmann, V.; Piir, G.; García-Sosa, A.T.; Takkis, K.; Oja, M.; Laigna, E.; Ahte, P.; Kahn, I.; Lomaka A. | 2015 | PCMDDD4 Book of Abstracts | 5.2. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Classifying bio-concentration factor with random forest algorithm, influence of the bio-accumulative vs. non-bio-accumulative compound ratio to modelling result, and applicability domain for random forest model | Piir, G.; Sild, S.; Maran, U. | 2014 | SAR and QSAR in Environmental Research | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Dual inhibition of the α-glucosidase and butyrylcholinesterase studied by Molecular Field Topology Analysis | Jabeen, Farukh; Oliferenko, Polina V.; Oliferenko, Alexander A.; Pillai, Girinath G.; Ansari, Farzana Latif; Hall, C. Dennis; Katritzky, Alan R. | 2014 | European Journal of Medicinal Chemistry | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool | ||
Improving the Use of Ranking in Virtual Screening against HIV‑1 Integrase with Triangular Numbers and Including Ligand Profiling with Antitargets | Garcia-Sosa, Alfonso T.; Maran, Uko | 2014 | Journal of Chemical Information and Modeling | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool ; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut | ||
Long-Range Chemical Ligation from N-- >N Acyl Migrations in Tryptophan Peptides via Cyclic Transition States of 10- to 18-Members | Biswas, Suvendu; Kayaleh, Roger; Pillai, Girinath G.; Seon, Christopher; Roberts, Ian; Popov, Vadim; Alamry, Khalid A.; Katritzky, Alan R. | 2014 | Chemistry - A European Journal | 1.1. | Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut, Molekulaartehnoloogia õppetool |