Lülijalgsete abil levivatel alfa- ja flaviviirustel on palju sarnaseid bioloogilisi omadusi; samas erinevad nad genoomide organisatsiooni ja ekspressiooni poolest. Viiruste RNAde süntees toimub RNA replikaasi abil; oletame, et nii viiruste sarnased omadused kui ka vektor-spetsiifilisus tulenevad RNA replikatsioonist. Kavas on uurida replikaasi ehitust ja toimimist lähtudes viiruse RNA ja valkude struktuuridest; uurimisvahenditena kasutame viiruse genoome ja nendel põhinevaid replikatsiooni süsteeme. Teeme kindlaks viiruse peremehe faktorite rollid Chikungunya ja O’nyong-nyong viiruste vektorülekandes. Replikaasi poolt aktiveeritavat sensorit kasutame reporter-hiirte loomiseks; selle mudeli abil uurime infektsiooni levimist ja viiruse püsimist organismis. Infektsiooni uurimiseks sääskedes kasutame flox-markereid kandvaid sääski ja Cre-rekombinaasi tootvaid viiruseid. Loodud katsesüsteeme ja saadud teadmiseid kasutame uute viirus-vastaste lähenemiste väljatöötamiseks.
Arthropod-transmitted alpha- and flaviviruses have RNA genomes and replicate using virus-encoded RNA replicase. Despite different genome organizations and gene expression strategies, alpha- and flaviviruses have similar biological properties. Here, we propose that these similarities as well as vector specificity are directly connected to the properties of the viral RNA replicase. A structure-guided approach applied to recombinant viruses and trans-replication systems will be used to analyze the RNA replication machineries. The role of replicase proteins and host cofactors in the vector specificity of Chikungunya and O’nyong-nyong viruses will be revealed. Novel replicase-activated reporter systems will be used to obtain transgenic mice to track virus spread and to detect persistent infection; Cre-expressing viruses and floxed markers will be used to track infection in mosquitoes. These systems and new knowledge will be used for the development of novel antiviral strategies.