See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Returning researcher grant / Tagasipöörduva teadlase toetus (MOBTP)" projekt MOBTP195
MOBTP195 "Viiruse genoomid, enamat kui RNA järjestus (1.10.2020−30.09.2022)", Margus Varjak, Tartu Ülikool, Loodus- ja täppisteaduste valdkond, tehnoloogiainstituut.
MOBTP195
Viiruse genoomid, enamat kui RNA järjestus
Viral genomes- more than RNA sequence
1.10.2020
30.09.2022
Teadus- ja arendusprojekt
Returning researcher grant / Tagasipöörduva teadlase toetus (MOBTP)
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.6 Bioteadused50,0
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaB210 Histoloogia, tsütokeemia, histokeemia, koekultuurid3.1 Biomeditsiin25,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.1. BiokeemiaP320 Nukleiinhappesüntees, proteiinisüntees 1.6 Bioteadused25,0
PerioodSumma
01.10.2020−30.09.2022108 003,54 EUR
108 003,54 EUR

On teada mitmeid RNAs olevate nukleotiidide biokeemilisi modifikatsioone ning need mõjutavad rRNA, tRNA ja mRNA funktsioneerimist. Modifikatsioonid, mida viivad läbi raku enda valgud, aitavad mõjutada geeni-ekspressiooni muutuvas keskkonnas. Hiljutised arengud metodoloogiates on võimaldanud leida RNA modifikatsioone ka viiruste RNA-des, kaasaarvatud moskiitode poolt levitavate flaviviiruste genoomides, nagu Zika viirus ja dengue'i palaviku viirus. Projekti esmaseks eesmärgiks on võrrelda modifikatsioone imetaja peremees-rakus ja moskiito vektor-rakus. Teine eesmärk on vaadelda, kas modifikatsioonidel on positiivne või negatiivne efekt viiruse paljunemisele. Ja kolmandaks tuleb vaadelda, kui oluline on modifikatsioonide roll viraalse RNA äratundmisel kaasasündinud immuunsüsteemi poolt. Projektis kasutatavad meetodid ja tehnikad on laiendatavad ka teistele RNA genoomiga viirustele.
There are several known biochemical modifications of nucleotides in RNA strands that impact functioning of cellular rRNAs, tRNAs and mRNAs. These modifications are carried out by cellular proteins and help to regulate gene expression in ever-changing environment. Recently, new methodologies have permitted to discover modifications in viral RNAs, including in the genomes of mosquito-transmitted flaviviruses, like dengue virus and Zika virus. The project’s first aim would characterise and compare Zika virus genome modifications in mammalian host and mosquito vector cells. Second aim would be to assess, whether modifications have positive or negative effects on virus replication. And thirdly, would modifications have role in viral RNA recognition by innate immune system. The methodologies and techniques for the project are expandable to other viruses with RNA genome as well.